甘蔗S-腺苷蛋氨酸脱羧酶基因Sc-SAMDC3的克隆和表达分析

作者: 文乐 [1] 黄诚梅 [2] 邓智年 [3] 曹辉庆 [2] 魏源文 [2] 李楠 [4] 吴凯朝 [3]

关键词: 甘蔗 S-腺苷蛋氨酸脱羧酶 Sc-SAMDC3 克隆 PEG胁迫

摘要：[目的]同源克隆干旱胁迫诱导下甘蔗(Saccharum officinarum)S-腺苷蛋氨酸脱羧酶3(S-adenosylmethionineDecarboxylase 3,SAMDC3)基因主编码区(mORF),并进行生物学信息及其表达特性分析,为该基因遗传转化研究奠定基础.[方法]以甘蔗Sc-SAMDC3基因序列为模板设计引物,克隆Sc-SAMDC3基因mORF并使用相关软件进行序列分析.采用实时荧光定量PCR分析Sc-SAMDC3基因在PEG-6000胁迫下的表达特性.[结果]Sc-SAMDC3基因主编码区长度为1188 bp,编码395个氨基酸.氨基酸序列分析结果显示,甘蔗SAMDC3有β折叠16个、α螺旋6个、卷曲3个,盘曲或折叠形成三级结构,酶活性中心残基位点分别位于第77、92、243、256位氨基酸残基,标志片段的酶原加工位点和PEST结构域与高粱、玉米高度保守.在25％ PEG-6000胁迫2～24h期间,Sc-SAMDC3基因的表达随胁迫诱导时间的延长而呈上调表达;至24 h时,其表达量为对照的8.26倍.[结论]克隆获得的Sc-SAMDC3基因表达受PEG-6000胁迫强烈诱导,可能参与甘蔗对干旱逆境胁迫响应的代谢调控.

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