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干旱胁迫下甘蔗苗期根系全长cDNA文库构建及EST序列分析
作者: 罗海斌 [1] ; 曹辉庆 [1] ; 魏源文 [1] ; 邓智年 [1] ; 潘有强 [1] ; 郭元元 [1] ; 何海波 [1] ; 李杨瑞 [1,2]
关键词: cDNA文库 甘蔗 根系 表达序列标签 测序
摘要：【目的】构建甘蔗根系全长cDNA文库，并进行测序，为分离克隆甘蔗抗旱候选基因奠定基础。【方法】在干旱胁迫条件下，以新台糖22号甘蔗根系为材料，采用SMART技术构建cDNA文库，并进行EST序列分析。【结果】文库构建质量鉴定结果显示，文库库容量为1．0xl0^6PFU／mL，重组率约95％，文库插入片段长度在500～2000bp，平均长度约1102．1bp。挑选526个阳性克隆进行单向测序后，共获得523个ESTs序列，去除载体、接头序列以及长度低于100bp的序列后，进行聚类分析并组装，共得到468个Uni—ESTs，其中congtig29个，singlets439个，分别占总数的6．5％和93．5％。通过与NCBI非冗余蛋白库进行BLASTXkL对，发现444个Uni—ESTs在GenBank有同源序列，占94．87％；获得24个未知蛋白功能基因，占5．13％。【结论】构建了干旱胁迫下甘蔗苗期根系全长cDNA文库，获得523个ESTs序列和468个Uni—ESTs，并获得一批新的未知蛋白功能基因。
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