金边鲤皮肤黑色素合成及转运相关基因表达分析

作者:韦玲静吕业坚邹辉文衍红甘宝江张桂姣张盛严雪瑜叶香尘

关键词: 金边鲤; 黑色素; 差异表达基因; 黑色素合成相关基因; 心肌肾上腺素通路; 色素沉着;

摘要：【目的】研究影响金边鲤皮肤色素沉着的关键基因及信号通路,揭示其皮肤颜色差异形成的原因,为金边鲤良种培育提供候选基因信息。【方法】基于突变型金边鲤黄色皮肤（Y组）和黑色皮肤（B组）及野生型金边鲤黑色皮肤（W组）的转录组测序数据,筛选分析获得部分共有差异表达基因,利用实时荧光定量PCR检测差异表达基因和黑色素合成相关基因的表达情况,并分析各基因间的相关性。【结果】依据转录组数据筛选获得ACT3、MYH2、TPM1、TPM2和TPM3共5个来源于心肌肾上腺素信号通路及与细胞动力相关的基因;除ACT3基因外,其余4个基因（MYH2、TPM1、TPM2和TPM3）在Y组皮肤中的相对表达量均显著低于B组和W组（P<0.05,下同）,与转录组分析的差异基因表达趋势一致。MC-1R、TYR、TYRP1和TYRP2等4个黑色素合成相关基因在金边鲤皮肤中的表达情况为:B组皮肤中MC-1R基因的相对表达量显著高于Y组和W组;TYR、TYRP1和TYRP2基因在3组皮肤中的相对表达量排序均为W组>B组>Y组,其中W组的相对表达量显著高于B组和Y组。相关性分析结果显示,MC-1R和TYR基因与ACT3、MYH2、TPM1、TPM2和TPM3基因呈显著或极显著（P<0.01）正相关,而TYRP1和TYRP2基因与这5个差异表达基因均无显著相关性（P>0.05）。【结论】ACT3、MYH2、TPM1、TPM2和TPM3基因及其所在的心肌肾上腺素信号通路可能影响黑色素合成与运动,且与黑色素合成相关基因存在相关性,可作为金边鲤体色变异研究中的标记基因。

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金边鲤皮肤黑色素合成及转运相关基因表达分析

作者:韦玲静 吕业坚 邹辉 文衍红 甘宝江 张桂姣 张盛 严雪瑜 叶香尘

关键词: 金边鲤; 黑色素; 差异表达基因; 黑色素合成相关基因; 心肌肾上腺素通路; 色素沉着;

作者:韦玲静吕业坚邹辉文衍红甘宝江张桂姣张盛严雪瑜叶香尘