咖啡种质资源遗传多样性的ISSR分析

作者:闫林黄丽芳王晓阳孙燕林兴军董云萍龙宇宙

关键词: 咖啡; ISSR; 遗传多样性; 聚类分析; 主坐标分析;

摘要：【目的】对我国收集保存的咖啡种质资源进行遗传多样性分析,为咖啡种质资源的收集、保存、鉴定、创新及有效利用提供理论参考。【方法】从哥伦比亚大学（UBC Primer Set#9）公布的100个ISSR引物序列中筛选出多态性好、扩增条带清晰且重复性好的引物,利用其对72份咖啡种质材料进行扩增,对电泳图谱进行统计分析,并利用NTSYSpc 2.1计算遗传相似系数和遗传距离。根据非加权算术平均法（UPGMA）进行聚类分析,并进行主坐标分析。【结果】筛选出的19条引物共扩增出153条条带,其中多态性条带数为128条,占总条带数的83.7%;72份咖啡种质材料间的遗传相似系数为0.4531～0.9609,平均为0.6567;遗传距离为0.0351～1.0951,平均为0.4081。其中,大粒种种内遗传相似系数最大（0.9297～0.9531）,遗传距离最小（0.0445～0.0669）;中粒种种内遗传相似系数最小（0.5781～0.8750）,遗传距离最大（0.1210～0.5363）。主坐标分析与聚类分析结果一致,均显示72份咖啡种质材料可分为三大类,其中3份大粒种、3份查理种及1份中粒种巴布亚新几内亚-2聚为Ⅰ类群;32份小粒种聚为聚为Ⅱ类群;除巴布亚新几内亚-2外的其他31份中粒种及1份中小粒杂交种Arabusta和1份福建咖啡共33份聚为Ⅲ类群。聚类分析结果与种质地理来源无明显相关性。【结论】咖啡种质资源各种间存在较大的遗传差异,以中粒种种内遗传多样性较丰富,以大粒种种内遗传多样性较低。利用ISSR分子标记可准确分析咖啡资源遗传多样性。

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咖啡种质资源遗传多样性的ISSR分析

作者:闫林 黄丽芳 王晓阳 孙燕 林兴军 董云萍 龙宇宙

关键词: 咖啡; ISSR; 遗传多样性; 聚类分析; 主坐标分析;

作者:闫林黄丽芳王晓阳孙燕林兴军董云萍龙宇宙