猪EIF2S3基因克隆测序及其组织表达谱分析

作者: 龙熙张廷焕赵久刚蓝静柴捷郭宗义王金勇张亮

关键词: 猪真核翻译起始因子2(eIF2) EIF2S3基因克隆序列分析组织表达谱

摘要：[目的]克隆猪EIF2S3基因mRNA全长,并进行生物信息学分析及检测其在猪各组织中的表达特征,为研究真核翻译起始因子2(eIF2)蛋白γ亚基的生物学功能打下基础.[方法]以荣昌猪胸腺mRNA为模板,采用RCAE-PCR克隆EIF2S3基因的mRNA全长序列,在线完成各种生物信息学分析后,利用实时荧光定量PCR分析猪EIF2S3基因的组织表达特征.[结果]猪EIF2S3基因mRNA全长1813 bp,其中蛋白质编码区(CDS)长1419 bp,5'UTR区、3'UTR区分别长14和380 bp,编码472个氨基酸.EIF2S3蛋白分子量51.1 kD,理论等电点(pI)8.62,包含58个带正电的氨基酸和52个带负电的氨基酸,其前体蛋白靠近N端区域有一个强疏水区;EIF2S3蛋白的空间结构由α-螺旋、β-折叠、延伸及无规则卷曲构成.EIF2S3蛋白氨基酸序列与狗和大白鼠的相似性最高(99.6％),其次是马、猫、牛、羊和人类(99.4％),与斑马鱼的相似性最低(96.6％).EIF2S3基因在猪的心脏、胸腺和淋巴组织中表达量较高,在脾脏和肌肉中呈中度表达,在肾脏中的表达量较低,而在肝脏中基本不表达.[结论]猪EIF2S3基因全长1813 bp,在核酸和氨基酸水平上与其他物种的EIF2S3基因高度同源,尤其与狗和大白鼠的遗传距离最近;其在猪心脏、胸腺和淋巴组织中的表达量较高,在肝脏中基本不表达,据此推测EIF2S3参与合成的蛋白更多地参与心脏泵血和免疫相关功能,基本不发挥能量代谢功能.

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猪EIF2S3基因克隆测序及其组织表达谱分析

作者: 龙熙 张廷焕 赵久刚 蓝静 柴捷 郭宗义 王金勇 张亮

关键词: 猪 真核翻译起始因子2(eIF2) EIF2S3基因 克隆 序列分析 组织表达谱

作者: 龙熙张廷焕赵久刚蓝静柴捷郭宗义王金勇张亮

关键词: 猪真核翻译起始因子2(eIF2) EIF2S3基因克隆序列分析组织表达谱