二穗短柄草钙依赖型蛋白激酶基因 BdCDPK14克隆及表达分析

作者: 韦淑亚 [1] 赵旭东 [2] 杨广笑 [2] 何光源 [2]

关键词: 二穗短柄草 BdCDPK14基因克隆生物信息学分析干旱胁迫表达

摘要：[目的]克隆分析二穗短柄草钙依赖型蛋白激酶(CDPK)基因BdCDPK14,并检测其在干旱胁迫下的表达量,为揭示钙依赖型蛋白激酶的抗旱调控机制打下基础.[方法]根据NCBI检索结果设计特异引物,以二穗短柄草cDNA为模板,采用PCR扩增二穗短柄草CDPK基因家族成员BdCDPK14,利用在线分析软件对BdCDPK14基因编码蛋白进行生物信息学分析,并采用RT-PCR检测PEG-6000干旱胁迫下的BdCDPK14基因表达量.[结果]从二穗短柄草叶片中克隆获得的BdCDPK14基因(GenBank登录号XM_003564390)片段长度1750 bp,其开放阅读框(ORF)1545 bp,编码514个氨基酸,其编码蛋白分子量56.78 kD,理论等电点5.45,脂肪指数78.21,不稳定指数38.66,属于稳定蛋白.BdCDPK14蛋白与小麦TaCPK13蛋白(ABY59018)的亲缘关系最近,含有4个EF-hands结构、蛋白酪氨酸激酶结构域、脂多糖激酶家族、ATP结合区域、丝氨酸/苏氨酸蛋白激酶激活区和预测跨膜区等结构域,主要由无规卷曲和α-螺旋构成,位于叶绿体和细胞质膜上.在PEG-6000干旱胁迫下,BdCDPK14基因在胁迫3 h内的相对表达量无明显变化,胁迫6 h后相对表达量开始升高,至胁迫12 h时的相对表达量最高.[结论]克隆获得的BdCDPK14基因为二穗短柄草CDPK基因家族成员之一,参与其抗干旱胁迫反应,可作为候选基因用于二穗短柄草抗旱机制研究.

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二穗短柄草钙依赖型蛋白激酶基因 BdCDPK14克隆及表达分析

作者: 韦淑亚 [1] 赵旭东 [2] 杨广笑 [2] 何光源 [2]

关键词: 二穗短柄草 BdCDPK14基因 克隆 生物信息学分析 干旱胁迫 表达

关键词: 二穗短柄草 BdCDPK14基因克隆生物信息学分析干旱胁迫表达