- · 院科技处组织召开2名博士后出站考核报告会[01/11]
- · 玉米所科技人员参加2020年度广西薯类创新团队总结考评会[01/10]
- · 柳州市柳江区科学技术局人员到葡萄所开展科技工作交流[01/09]
- · 蔬菜所与柳州市柳江区科学技术局开展产学研平台建设座谈会[01/08]
- · 广西热作所农产品质量安全产业科技先锋队到博白县、北流市开展科技服务[01/08]
- · 广西甘蔗生产服务公司人员到甘蔗所座谈交流[01/08]
- · 生物所组织开展防冻抗灾工作[01/07]
- · 广西创新驱动发展专项《广西甘蔗原料蔗亩增1吨关键技术粉垄“145”模式研究与示范》项目启动会在崇左召开[01/07]
13种植物actin基因的密码子使用特性分析
作者: 赵洋 杨培迪 刘振 成杨 杨阳
关键词: actin基因 密码子用法 密码子偏性
摘要:[目的]分析13种植物actin基因的密码子组成、密码子偏性及聚类关系,了解其密码子使用模式及影响密码子使用的因素,为深入研究分子进化及物种进化提供参考.[方法]运用CodonW 1.4.4软件分析13种植物的肌动蛋白基因(actin)密码子组成及使用参数,并对影响密码子偏性的因素进行研究.应用MEGA 4.1对13条基因的CDS序列进行聚类分析,采用SPSS 20.0进行密码子偏性的聚类分析.[结果]双子叶植物中actin基因的GC含量为45.0%~51.2%、GC3s含量为36.3%~53.8%,单子叶植物中GC含量为53.0%~58.3%、GC3s含量为60.9%~75.8%;actin基因在单子叶植物中偏爱G/C结尾的密码子,双子叶植物中偏爱A/T结尾的密码子.GC和GC3s与有效密码子数(ENC)呈极显著负相关(P<0.01),相关系数均为-0.906.ENC绘图分析结果表明,actin基因密码子偏性同时受突变和选择压力影响,单子叶植物受选择压力影响的程度大于双子叶植物.基于actin基因密码子偏性的聚类将单子叶植物高粱、玉米聚为一类,水稻、大麦、竹聚为一类,8种双子叶植物聚为一类.[结论]actin基因密码子偏性与碱基组成密切相关,其密码子偏性在单、双子叶植物间存在差异,依据密码子偏性的聚类能在一定程度上反映物种间的亲缘关系.
上一篇: 桂糖11号Rubisco基因克隆、原核表达及纯化
下一篇:最后一页